La maladie la plus fréquente et dommageable sur les épis des céréales est la fusariose. Elle est causée par un complexe d’espèces du genre Fusarium (espèces produisant des toxines) et Microdochium (non toxinogènes).

Les symptômes sont très variés et la distinction entre les espèces est très compliquée voire impossible sur la base seule des symptômes. Pour identifier la ou les espèces responsables, il faut observer les spores au microscope ou réaliser des analyses moléculaires. Néanmoins, quelques éléments peuvent aider au diagnostic.  Des épillets contaminés par certains genres Fusarium (F. graminearum notamment) ou Microdochium échaudent de manière isolée ou par groupe, pouvant aller jusqu’à un échaudage complet de l’épi (photo). Ils peuvent prendre une couleur rose-orangé. Une ou plusieurs auréoles noires sur une glume de couleur marron plus ou moins clair à noir sont visibles dans certains cas. Le brunissement du col de l’épi est possible pour différents Fusarium, notamment F. graminearum ; il entraîne souvent le dessèchement total de l’épi.

Les symptômes de fusariose sont très diversifiés, allant d’un épillet isolé à l’échaudage complet de l’épi. Il est très difficile de différencier les espèces en cause.

Avec les conditions très pluvieuses de l’année au moment de la floraison et après, les températures assez « fraîches » et un rayonnement globalement faible, le risque Microdochium est assez élevé cette année. Le risque est également fort dans les parcelles à risque F. graminearum, tel qu’évalué grâce à la grille de risque ARVALIS.